脈沖布袋除塵器工作時，含塵氣體由進風道進入灰斗，粗塵粒直接落入灰斗底部，細塵粒隨氣流轉折向上進入中、下箱體，粉塵積附在濾袋外表面，過濾后的氣體進入上箱體至凈氣集合管排風道，經排風機排至大氣。清灰過程是先切斷該室的凈氣出入口風道，使該室的布袋處于無氣流通過的狀態。然后開啟脈沖閥用壓縮空氣進行脈沖噴吹清灰，切斷閥關閉時間足以確定在噴吹后從濾袋上剝離的粉塵沉降至灰斗，避免了粉塵在脫離濾袋表面后又隨氣流附集到相鄰濾袋表面的現象，使濾袋清灰，并由可編程序控制儀對排氣閥、脈沖閥及卸灰閥等進行全自動控制。

正因為木材散碎物料有其性質，適合其他散碎物料的布袋除塵器不適合木材散碎物料的分離除塵。根據布袋除塵器的清灰方式，可將其分為振搖式袋式除塵器、反吹氣流式袋式除塵器、脈沖氣流反吹式袋式除塵器等。目前，在木材工業中廣泛使用的袋式除塵器有旋風袋式除塵器、慣性脈沖袋式除塵器、旋風脈沖袋式除塵器等。這主要是根據袋式除塵器的清灰方式進行分類的。